D’une durée maximale de trois ans, les projets de recherche (fondamentale ou appliquée), visent à répondre à des questions scientifiques au travers d’approches pluridisciplinaires et d’un examen conjoint d’infrastructures linéaires de nature différentes.

Les projets, dits « exploratoires », sont financés en parallèles aux projets de recherche. L’objectif des projets exploratoires, d’une durée maximale d’un an, est d’aboutir à des analyses de nature prospective ou liées à des sujets novateurs ou très peu explorées.

La revue systématique est un exercice qui a vocation à répondre à une question sur la base de la littérature, aussi bien scientifique que "grise" que "blanche", via un protocole standardisé et accrédité à l’échelle internationale. Issu du domaine médical et développé à l’étranger, ce type de démarche est nouveau en France et d’autant plus dans le domaine de l’écologie.